Organigramme
Les salariés de la station de Lorient travaillent tous dans l'unité "Sciences et Technologie Halieutiques". Celle-ci est divisée en 2 laboratoires scientifiques : le Laboratoire de Biologie Halieutique et le Laboratoire de Technologie Halieutique. Parallèlement 3 salariés dépendent également de la station de Lorient qui est chargée essentiellement de la logistique, des affaires régionales et de la communication. La station héberge aussi un chercheur qui fait partie de l'unité Biotechnologies et Ressources Marines de l'Ifremer à Nantes.